Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATRNL1Q5VV63 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms