Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321 ms