Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms