Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFI1BQ5VTD9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms