Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms