Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH8Q5T0T0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms