Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NHSL1Q5SYE7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms