Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHYHD1Q5SRE7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms