Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAT1Q5SQI0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAT1Q5SQI0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms