Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms