Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms