Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A8Q2Y0W8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms