Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TYSND1Q2T9J0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1534.7 ms