Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B3Q16720 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B3Q16720 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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