Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX1AQ16623 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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