Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYPL1Q16563 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYPL1Q16563 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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