Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRA6Q16445 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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