Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTX1Q15818 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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