Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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