Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH1Q15438 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms