Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SF3A2Q15428 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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