Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUM3Q15397 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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