Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B3Q15393 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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