Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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RAB35Q15286 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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RAB35Q15286 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RAB35Q15286 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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RAB35Q15286 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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