Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms