Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN1Q15223 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
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