Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms