Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPHQ15003 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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