Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RAB39AQ14964 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RAB39AQ14964 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RAB39AQ14964 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RAB39AQ14964 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RAB39AQ14964 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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