Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C1DQ13901 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1DQ13901 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1DQ13901 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1DQ13901 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1DQ13901 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1DQ13901 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1DQ13901 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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