Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD4Q13485 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms