Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSAMPQ13449 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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