Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED1Q13445 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED1Q13445 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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