Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DYNC1I2Q13409 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DYNC1I2Q13409 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms