Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRSQ13332 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRSQ13332 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRSQ13332 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRSQ13332 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRSQ13332 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRSQ13332 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRSQ13332 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRSQ13332 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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PTPRSQ13332 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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PTPRSQ13332 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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PTPRSQ13332 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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