Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.413e-9■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 HAUS1-205ENST00000588704 937 ntTSL 39.09□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 HAUS1-208ENST00000591715 1098 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.323e-9■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 HAUS1-202ENST00000585425 370 ntTSL 36.43□□□□□ -1.383e-9■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 PABPC1-204ENST00000517990 487 ntTSL 57.74□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.371e-9■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.27e-9■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 GTF3C2-207ENST00000457098 762 ntTSL 311.74□□□□□ -0.531e-10■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 GTF3C2-213ENST00000495298 1064 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-10■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-10■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 GTF3C2-205ENST00000431028 592 ntTSL 310.41□□□□□ -0.741e-10■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-10■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.522e-31■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.322e-31■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 PSMA1-203ENST00000524606 646 ntTSL 26.51□□□□□ -1.373e-14■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-12■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 PFDN5-208ENST00000549995 598 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-12■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 PFDN5-215ENST00000551223 478 ntTSL 411.24□□□□□ -0.612e-12■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 PFDN5-205ENST00000547228 726 ntTSL 57.28□□□□□ -1.242e-12■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 PFDN5-209ENST00000550069 599 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-12■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.912e-18■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 RPS29-207ENST00000557367 499 ntTSL 216.31■□□□□ 0.22e-18■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.112e-18■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-18■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 MAMDC4-205ENST00000485732 4112 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -04e-9■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 CCNI-208ENST00000515468 636 ntTSL 36.08□□□□□ -1.444e-15■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.585e-10■■■■■ 29.6
PABPC4Q13310 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SIVA1-204ENST00000553810 550 ntTSL 322.68■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SIVA1-206ENST00000554013 461 ntTSL 1 (best)22.06■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 AC004148.2-201ENST00000575890 1938 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 29.5
PABPC4Q13310 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.548e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.468e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.468e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.448e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 NPC2-206ENST00000555592 469 ntTSL 522.32■■□□□ 1.168e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.888e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.848e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.648e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.68e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 MECR-205ENST00000463412 915 ntTSL 517.18■□□□□ 0.348e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 TPD52L1-216ENST00000571678 2486 nt13.54□□□□□ -0.248e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 TPD52L1-204ENST00000392482 1165 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.248e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.878e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.988e-9■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-229ENST00000585269 1346 ntTSL 526.6■■□□□ 1.851e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.141e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.031e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.928e-8■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-206ENST00000417808 923 ntTSL 220.55■□□□□ 0.881e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.738e-8■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-205ENST00000471896 2129 ntTSL 219.31■□□□□ 0.681e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 SELENOM-207ENST00000490967 2070 ntTSL 1 (best)18.61■□□□□ 0.578e-8■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-227ENST00000584850 2442 ntTSL 217.97■□□□□ 0.471e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-207ENST00000418143 843 ntTSL 316.67■□□□□ 0.261e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-208ENST00000488876 2404 ntTSL 216.31■□□□□ 0.21e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-210ENST00000433430 4671 ntTSL 514.32□□□□□ -0.121e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-209ENST00000429283 4332 ntTSL 212.82□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-211ENST00000434477 659 ntTSL 312.24□□□□□ -0.451e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-201ENST00000273009 3201 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 STARD3-206ENST00000481171 3451 ntTSL 212.01□□□□□ -0.491e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-203ENST00000390005 3328 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.951e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.211e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-12■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.332e-7■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 G6PC3-204ENST00000588558 1718 ntTSL 1 (best)20.91■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 G6PC3-202ENST00000585361 1572 ntTSL 220.45■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 G6PC3-205ENST00000590253 844 ntTSL 519.05■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 HIST1H4C-201ENST00000377803 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.353e-10■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 RPL15-204ENST00000413699 2053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.393e-10■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 SAT1-205ENST00000462639 826 ntTSL 25.39□□□□□ -1.552e-15■■■■■ 29.4
PABPC4Q13310 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.274e-8■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.994e-8■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.84e-8■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 RELA-208ENST00000526283 2004 ntTSL 515.53■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 29.3
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