Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERCC8Q13216 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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