Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL28Q13084 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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