Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A2Q12974 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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