Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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