Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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RAB40BQ12829 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB40BQ12829 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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RAB40BQ12829 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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RAB40BQ12829 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB40BQ12829 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB40BQ12829 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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RAB40BQ12829 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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RAB40BQ12829 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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RAB40BQ12829 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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RAB40BQ12829 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB40BQ12829 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB40BQ12829 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RAB40BQ12829 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RAB40BQ12829 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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