Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXO1Q12778 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXO1Q12778 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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