Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYCNQ0VAF6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321 ms