Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP4Q09028 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP4Q09028 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms