Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD47Q08722 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD47Q08722 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD47Q08722 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD47Q08722 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD47Q08722 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD47Q08722 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD47Q08722 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD47Q08722 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms