Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSC1Q08554 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms