Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR3Q06889 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms