Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms