Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 CTK1YKL139W 1587 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 TAX4YJL083W 1815 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 KEL1YHR158C 3495 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 CBP4YGR174C 513 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 IMP1YMR150C 573 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 TPM1YNL079C 600 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 ATG3YNR007C 933 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MRPS12YNR036C 462 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 VID24YBR105C 1089 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MPP10YJR002W 1782 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 NMD3YHR170W 1557 nt5.97□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 ERG1YGR175C 1491 nt5.96□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 MCM3YEL032W 2916 nt5.96□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 NOP12YOL041C 1380 nt5.96□□□□□ -1.45
HDA3Q06623 UTP18YJL069C 1785 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 JJJ1YNL227C 1773 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 FRS2YFL022C 1512 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SPC97YHR172W 2472 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 CET1YPL228W 1650 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YDR396WYDR396W 501 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YEL068CYEL068C 333 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YJL028WYJL028W 336 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 FMP33YJL161W 543 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YPR114WYPR114W 948 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 BAP2YBR068C 1830 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ERG4YGL012W 1422 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ENP2YGR145W 2124 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 MRC1YCL061C 3291 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 MET7YOR241W 1647 nt5.96□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YME1YPR024W 2244 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 MMT1YMR177W 1533 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 VPS17YOR132W 1656 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 HIS7YBR248C 1659 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 PKC1YBL105C 3456 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YCL068CYCL068C 783 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 UGA3YDL170W 1587 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 DAD1YDR016C 285 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 GIR2YDR152W 798 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 LOC1YFR001W 615 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YHL018WYHL018W 363 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RPE1YJL121C 717 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YJL175WYJL175W 513 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNK1YKL067W 462 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 HRI1YLR301W 735 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RLP7YNL002C 969 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 GAS4YOL132W 1416 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ETR1YBR026C 1143 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YOR387CYOR387C 621 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 MRPS16YPL013C 366 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 DSS4YPR017C 432 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 OPY1YBR129C 987 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 CHK1YBR274W 1584 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ARP4YJL081C 1470 nt5.95□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 CSC1YLR241W 2349 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 APN2YBL019W 1563 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 IOC4YMR044W 1428 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YLL067CYLL067C 3618 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 VHT1YGR065C 1782 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 VMA22YHR060W 546 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 LRP1YHR081W 555 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YJR020WYJR020W 333 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 COX17YLL009C 210 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ZRT2YLR130C 1269 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SEC22YLR268W 645 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YPT7YML001W 627 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 FOL3YMR113W 1284 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNL019CYNL019C 855 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNL033WYNL033W 855 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNR021WYNR021W 1215 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ZPS1YOL154W 750 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RMI1YPL024W 726 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 PBN1YCL052C 1251 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 VNX1YNL321W 2727 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 BUD27YFL023W 2391 nt5.94□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RTT106YNL206C 1368 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 AVT5YBL089W 1380 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 NGG1YDR176W 2109 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 VPS5YOR069W 2028 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RGD1YBR260C 2001 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 GPB2YAL056W 2643 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 FIN1YDR130C 876 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RGI1YER067W 486 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YMR254CYMR254C 309 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YNL109WYNL109W 546 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SEC66YBR171W 621 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 BRE2YLR015W 1518 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 NOP56YLR197W 1515 nt5.93□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ICL1YER065C 1674 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 ATG4YNL223W 1485 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YDL012CYDL012C 324 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 YDR015CYDR015C 240 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 DPP1YDR284C 870 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 THO1YER063W 657 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RTT102YGR275W 474 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 RPL16AYIL133C 600 nt5.92□□□□□ -1.46
HDA3Q06623 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms