Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX1T1Q06455 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms